Der Burgenlandkreis verfügt über eine vielfältige Wirtschaftsstruktur. In der Saale-Unstrut-Region um Naumburg spielen Weinanbau und Kulturtourismus eine wichtige Rolle. Die Mittelzentren Zeitz und Weißenfels sind zwei traditionelle Industriestandorte. In beiden Städten stellt zudem die Lebensmittelbranche ein wichtiges wirtschaftliches Standbein dar. Im Bündnis „BioZ – Biobasierte Innovationen aus Zeitz und Mitteldeutschland“ vereinen Akteure der Region ihre Kompetenzen in den Bereichen Agrar-, Lebensmittel- und Chemieindustrie sowie Anlagenbau.

Der Burgenlandkreis ist besonders vom Braunkohleausstieg betroffen. Mit dem Braunkohle-Abbaugebiet Profen verfügt er über einen noch aktiven Tagebau. Die Mitteldeutsche Braunkohlengesellschaft (MIBRAG), einer der größten Arbeitgeber der Region, hat ihren Sitz in Zeitz. Die MIBRAG vollzieht gegenwärtig eine Transformation und will sich als Produzent erneuerbarer Energien – vor allem aus Wind und Sonne – neu aufstellen.